Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SNX29Q8TEQ0 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms