Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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C9orf135Q5VTT2 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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C9orf135Q5VTT2 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C9orf135Q5VTT2 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.59□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.59□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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