Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDKN3Q16667 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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