Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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