Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFRLQ15198 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 445.8 ms