Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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