Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms