Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PKP1Q13835 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKP1Q13835 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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