Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms