Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CACNA1SQ13698 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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