Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms