Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
XRCC4Q13426 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.59□□□□□ -2
XRCC4Q13426 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
XRCC4Q13426 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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