Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATMQ13315 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATMQ13315 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATMQ13315 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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