Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GRIN2BQ13224 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms