Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RESTQ13127 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RESTQ13127 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms