Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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