Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRDM2Q13029 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms