Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms