Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CNTN1Q12860 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CNTN1Q12860 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CNTN1Q12860 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CNTN1Q12860 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CNTN1Q12860 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CNTN1Q12860 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNTN1Q12860 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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