Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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