Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
J3KRW8 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
J3KRW8 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
J3KRW8 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms