Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms