Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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