Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KCNS3Q9BQ31 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms