Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms