Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LRRIQ1Q96JM4 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRIQ1Q96JM4 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms