Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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UBXN4Q92575 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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UBXN4Q92575 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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UBXN4Q92575 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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UBXN4Q92575 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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UBXN4Q92575 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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UBXN4Q92575 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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UBXN4Q92575 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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UBXN4Q92575 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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