Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms