Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NDUFA9Q16795 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms