Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms