Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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