Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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TNXAQ16473 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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TNXAQ16473 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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TNXAQ16473 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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