Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ZNF56Q15929 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms