Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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