Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPTX1Q15818 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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