Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CHD4Q14839 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms