| CHD4 | Q14839 | AC015724.1-201 | ENST00000478577 | 156 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | EPGN-204 | ENST00000502358 | 312 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | EPGN-206 | ENST00000503098 | 339 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | EPGN-207 | ENST00000505212 | 285 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | EPGN-209 | ENST00000514968 | 312 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | snoZ278.1-201 | ENST00000517059 | 112 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC023442.2-201 | ENST00000526455 | 270 nt | TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC118942.1-202 | ENST00000529081 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC010127.1-205 | ENST00000595268 | 567 nt | TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | SATB1-AS1-222 | ENST00000600177 | 751 nt | TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU4-5P-201 | ENST00000607255 | 135 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | PLSCR2-206 | ENST00000610787 | 1001 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | uc_338.9-201 | ENST00000617424 | 182 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR6873-201 | ENST00000622788 | 63 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC000367.1-201 | ENST00000452711 | 1766 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | Y_RNA.122-201 | ENST00000363331 | 96 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL31P52-201 | ENST00000407532 | 367 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | NT5C3A-205 | ENST00000409467 | 1032 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL391839.1-201 | ENST00000417447 | 265 nt | TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC108667.1-201 | ENST00000428618 | 249 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC01078-201 | ENST00000434832 | 387 nt | TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | SATB1-AS1-204 | ENST00000453361 | 726 nt | TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | NF1P3-201 | ENST00000457709 | 450 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC104689.1-201 | ENST00000473356 | 768 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC026414.1-201 | ENST00000504046 | 698 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC025244.2-201 | ENST00000509215 | 422 nt | TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC018541.1-202 | ENST00000518687 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC01932-201 | ENST00000520323 | 573 nt | TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC004217.3-201 | ENST00000551552 | 878 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR6845-201 | ENST00000613182 | 61 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL121895.2-201 | ENST00000619558 | 447 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | C8orf59-213 | ENST00000619594 | 859 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL512506.2-201 | ENST00000624472 | 458 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC02516-201 | ENST00000563724 | 1771 nt | TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | CNOT6L-201 | ENST00000504123 | 8843 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF732-202 | ENST00000619749 | 2179 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR5T2-201 | ENST00000313264 | 1248 nt | APPRIS P2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-353P-201 | ENST00000364266 | 108 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | U8.13-201 | ENST00000390842 | 128 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-298P-201 | ENST00000390888 | 96 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL603865.2-201 | ENST00000401679 | 213 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | SPA17P1-201 | ENST00000416656 | 452 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | BLOC1S2P1-201 | ENST00000428431 | 301 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC023347.2-201 | ENST00000433994 | 462 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC009987.1-201 | ENST00000446888 | 806 nt | TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL589963.1-201 | ENST00000449282 | 727 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC069549.1-201 | ENST00000451584 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | PTGES3P5-201 | ENST00000455109 | 434 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | BX248409.1-201 | ENST00000455497 | 255 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | GYPA-204 | ENST00000504786 | 357 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU6-276P-201 | ENST00000516114 | 96 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | DEFB130C-202 | ENST00000530001 | 230 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | CASP1-212 | ENST00000531166 | 300 nt | TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC023796.1-201 | ENST00000536131 | 670 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC012404.2-201 | ENST00000558572 | 481 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC090771.2-201 | ENST00000588794 | 571 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC069545.1-201 | ENST00000605671 | 358 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC024060.1-201 | ENST00000607052 | 494 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC018926.3-201 | ENST00000618841 | 406 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | SGO1P1-201 | ENST00000603525 | 1447 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | NEB-218 | ENST00000603639 | 25578 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | NEB-219 | ENST00000604864 | 25578 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AGTR1-205 | ENST00000461609 | 1545 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | WDR49-201 | ENST00000308378 | 2594 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC02070-201 | ENST00000460586 | 1321 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR4P4-201 | ENST00000314612 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL136310.1-201 | ENST00000404926 | 654 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC114973.1-201 | ENST00000429057 | 632 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL024508.1-201 | ENST00000432477 | 505 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AP000855.1-201 | ENST00000433210 | 636 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | RN7SL283P-201 | ENST00000489055 | 303 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC022790.1-201 | ENST00000522872 | 204 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC015771.1-201 | ENST00000527283 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | ELOCP31-201 | ENST00000540463 | 467 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC130462.1-201 | ENST00000548144 | 549 nt | TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTCYBP27-201 | ENST00000555160 | 670 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | MTND1P8-201 | ENST00000571424 | 950 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC011933.3-201 | ENST00000578226 | 372 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CHD4 | Q14839 | GABPAP-201 | ENST00000419271 | 1356 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | PKIB-201 | ENST00000258014 | 1595 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF29P-201 | ENST00000225587 | 168 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR8B3-201 | ENST00000354597 | 942 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | SNORA25.6-201 | ENST00000364121 | 118 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR8B2-201 | ENST00000375013 | 942 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR16-1-201 | ENST00000385271 | 89 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | TRAV7-201 | ENST00000390429 | 337 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | AGR3-202 | ENST00000402239 | 563 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL359511.1-201 | ENST00000402970 | 211 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU2-42P-201 | ENST00000410697 | 113 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL31P2-201 | ENST00000413849 | 377 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL356320.2-201 | ENST00000417263 | 507 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL357833.2-201 | ENST00000426811 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL645638.1-201 | ENST00000440519 | 361 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | HMGB3P21-201 | ENST00000452483 | 547 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC087241.1-201 | ENST00000508615 | 429 nt | TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | IGJP1-201 | ENST00000522682 | 475 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR8L1P-201 | ENST00000534005 | 955 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | HPRT1P3-201 | ENST00000539521 | 576 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | RAP1B-224 | ENST00000541216 | 701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC068446.3-201 | ENST00000555285 | 382 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |