Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CCINQ13939 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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CCINQ13939 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CCINQ13939 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CCINQ13939 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CCINQ13939 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCINQ13939 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCINQ13939 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCINQ13939 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCINQ13939 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CCINQ13939 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCINQ13939 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCINQ13939 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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