Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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