Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB2AQ13885 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms