Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATRQ13535 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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