Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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