Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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