Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP3B2Q13367 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms