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| PAPPA | Q13219 | AC012150.2-201 | ENST00000621300 | 544 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
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| PAPPA | Q13219 | SOX2-OT-224 | ENST00000595313 | 716 nt | TSL 5 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| PAPPA | Q13219 | ZNF451-208 | ENST00000491832 | 3632 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| PAPPA | Q13219 | PIK3C2G-203 | ENST00000535651 | 2497 nt | TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | SNORA16.1-201 | ENST00000364597 | 132 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | Z98749.2-208 | ENST00000381646 | 500 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | AC069257.1-202 | ENST00000425275 | 422 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | AL160411.1-201 | ENST00000429853 | 400 nt | TSL 2 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | RPS7P2-201 | ENST00000435134 | 607 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | RPS15AP7-201 | ENST00000439294 | 405 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | OR51B8P-201 | ENST00000449892 | 769 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | SNORD108-201 | ENST00000459332 | 71 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | AC012181.1-201 | ENST00000479895 | 423 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | HMGB1P47-201 | ENST00000511281 | 589 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | AC090753.1-201 | ENST00000522087 | 331 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | AL163153.1-201 | ENST00000554223 | 283 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | AC021549.1-201 | ENST00000580937 | 433 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
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| PAPPA | Q13219 | LINC01359-207 | ENST00000634799 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | CAPZA2-215 | ENST00000639546 | 129 nt | TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | RNF128-202 | ENST00000324342 | 2654 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | MTND4P23-201 | ENST00000447723 | 1363 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | MGAT4C-207 | ENST00000552808 | 1937 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | NEB-203 | ENST00000397345 | 26202 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | NEB-209 | ENST00000427231 | 26202 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | COMMD6-201 | ENST00000355801 | 486 nt | TSL 2 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | TAS2R15P-201 | ENST00000390674 | 928 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| PAPPA | Q13219 | AC104462.1-201 | ENST00000414565 | 447 nt | TSL 2 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |