Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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CBX3Q13185 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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