Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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