Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms