Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB40BQ12829 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms