Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TROQ12816 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TROQ12816 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TROQ12816 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TROQ12816 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TROQ12816 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TROQ12816 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TROQ12816 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TROQ12816 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TROQ12816 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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