Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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PGGT1BP53609 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP53609 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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